Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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