Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NKD1Q969G9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKD1Q969G9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms