Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSR2Q969E8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms