Protein–RNA interactions for Protein: Q93074

MED12, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED12Q93074 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED12Q93074 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED12Q93074 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED12Q93074 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED12Q93074 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED12Q93074 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED12Q93074 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED12Q93074 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED12Q93074 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED12Q93074 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED12Q93074 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED12Q93074 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED12Q93074 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED12Q93074 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED12Q93074 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED12Q93074 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED12Q93074 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MED12Q93074 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED12Q93074 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED12Q93074 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED12Q93074 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED12Q93074 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED12Q93074 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED12Q93074 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED12Q93074 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED12Q93074 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED12Q93074 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED12Q93074 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED12Q93074 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED12Q93074 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED12Q93074 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED12Q93074 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED12Q93074 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED12Q93074 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED12Q93074 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED12Q93074 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED12Q93074 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED12Q93074 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED12Q93074 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED12Q93074 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED12Q93074 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED12Q93074 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED12Q93074 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MED12Q93074 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED12Q93074 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED12Q93074 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED12Q93074 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED12Q93074 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED12Q93074 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED12Q93074 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED12Q93074 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED12Q93074 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED12Q93074 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED12Q93074 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED12Q93074 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED12Q93074 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED12Q93074 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED12Q93074 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED12Q93074 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED12Q93074 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED12Q93074 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED12Q93074 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED12Q93074 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED12Q93074 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED12Q93074 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED12Q93074 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED12Q93074 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED12Q93074 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED12Q93074 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED12Q93074 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED12Q93074 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED12Q93074 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED12Q93074 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED12Q93074 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED12Q93074 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED12Q93074 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED12Q93074 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED12Q93074 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MED12Q93074 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED12Q93074 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED12Q93074 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED12Q93074 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED12Q93074 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED12Q93074 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED12Q93074 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED12Q93074 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MED12Q93074 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED12Q93074 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED12Q93074 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MED12Q93074 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED12Q93074 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED12Q93074 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED12Q93074 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED12Q93074 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED12Q93074 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED12Q93074 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED12Q93074 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED12Q93074 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED12Q93074 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MED12Q93074 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms