Protein–RNA interactions for Protein: Q92738

USP6NL, USP6 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6NLQ92738 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms