Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNAAF4Q8WXU2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms