Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms