Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms