Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG50

RDM1, RAD52 motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDM1Q8NG50 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RDM1Q8NG50 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDM1Q8NG50 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms