Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

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Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
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TTC21AQ8NDW8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TTC21AQ8NDW8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
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