Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM35BQ8NCS4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms