Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms