Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IGSF1Q8N6C5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms