Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms