Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms