Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms