Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms