Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY92

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, humanhuman

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4Q8IY92 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms