Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU89

CERS3, Ceramide synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS3Q8IU89 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CERS3Q8IU89 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CERS3Q8IU89 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CERS3Q8IU89 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CERS3Q8IU89 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CERS3Q8IU89 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CERS3Q8IU89 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CERS3Q8IU89 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CERS3Q8IU89 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERS3Q8IU89 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERS3Q8IU89 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CERS3Q8IU89 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERS3Q8IU89 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERS3Q8IU89 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERS3Q8IU89 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERS3Q8IU89 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERS3Q8IU89 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERS3Q8IU89 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERS3Q8IU89 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERS3Q8IU89 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERS3Q8IU89 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERS3Q8IU89 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CERS3Q8IU89 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERS3Q8IU89 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CERS3Q8IU89 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERS3Q8IU89 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERS3Q8IU89 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERS3Q8IU89 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERS3Q8IU89 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERS3Q8IU89 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CERS3Q8IU89 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms