Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFNL1Q8IU54 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms