Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRCQ7RTU9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms