Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms