Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HS2ST1Q7LGA3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms