Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYFIP1Q7L576 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYFIP1Q7L576 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYFIP1Q7L576 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYFIP1Q7L576 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYFIP1Q7L576 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms