Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2AFVQ71UI9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms