Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
XIRP1Q702N8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
XIRP1Q702N8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
XIRP1Q702N8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
XIRP1Q702N8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
XIRP1Q702N8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XIRP1Q702N8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XIRP1Q702N8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
XIRP1Q702N8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
XIRP1Q702N8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
XIRP1Q702N8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
XIRP1Q702N8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
XIRP1Q702N8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XIRP1Q702N8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
XIRP1Q702N8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XIRP1Q702N8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
XIRP1Q702N8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
XIRP1Q702N8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XIRP1Q702N8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
XIRP1Q702N8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms