Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC141Q6ZP82 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC141Q6ZP82 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms