Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREML4Q6UXN2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms