Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms