Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms