Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms