Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KANK3Q6NY19 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms