Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms