Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GDF6Q6KF10 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms