Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SUMO4Q6EEV6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms