Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms