Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms