Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAMD5Q5TGI4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms