Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms