Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDSS1Q5T2R2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms