Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
MARCH8Q5T0T0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms