Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms