Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms