Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms