Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAVIN4Q5BKX8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms