Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms