Protein–RNA interactions for Protein: Q53FD0

ZC2HC1C, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1CQ53FD0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC2HC1CQ53FD0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms