Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CFAP221Q4G0U5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CFAP221Q4G0U5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CFAP221Q4G0U5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CFAP221Q4G0U5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CFAP221Q4G0U5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CFAP221Q4G0U5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CFAP221Q4G0U5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CFAP221Q4G0U5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CFAP221Q4G0U5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CFAP221Q4G0U5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CFAP221Q4G0U5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CFAP221Q4G0U5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms