Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms