Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A8Q2Y0W8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A8Q2Y0W8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A8Q2Y0W8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A8Q2Y0W8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A8Q2Y0W8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A8Q2Y0W8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A8Q2Y0W8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A8Q2Y0W8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A8Q2Y0W8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A8Q2Y0W8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A8Q2Y0W8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A8Q2Y0W8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A8Q2Y0W8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A8Q2Y0W8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A8Q2Y0W8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A8Q2Y0W8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A8Q2Y0W8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A8Q2Y0W8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A8Q2Y0W8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A8Q2Y0W8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A8Q2Y0W8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms